O desmatamento de áreas nativas desequilibra os ecossistemas expondo na maioria das vezes os solos pouco férteis aos agentes erosivos. Com isso estudos para verificar o comportamento de espécies arbóreas em diferentes composições de substratos de cultivo são necessários para a produção de mudas de melhor qualidade e com menor dependência de insumos externos. Objetivo desse trabalho foi avaliar a influência da calagem, adubação fosfatada e do isoflavonóide formononetina na micorrização e na nodulação natural em mudas de Anadenanthera macrocarpa. As mudas foram cultivadas em Latossolo Amarelo distrófico, coletado a uma profundidade de 90 a 180 cm e submetido aos tratamentos realizados com duas doses de calcário dolomítico PRNT 91% (0 e 1,61g Kg-1), cinco doses de adubo fosfatado misto da marca Heringer® 0, 200, 400, 600 e 800 mg dm-3 e duas doses de isoflavonóide formononetina (0 e 1,0 g). O delineamento utilizado foi o inteiramente casualizado (DIC) em esquema fatorial foi 2x5x2, totalizando 20 tratamentos e 10 repetições. Também foram adicionados 100 g de solo coletado na camada de 0 a 5 cm em área de mata nativa para servir como inóculo de esporos e bactérias nativas. A aplicação de isoflavonóide formononetina em solo sem correção da acidez contribui significativamente para o aumento da porcentagem da colonização micorrízica, nodulação espontânea das mudas.